Cara mengonversi file TXT ke FASTA

Langkah 1

Buka file teks dengan urutan protein yang ingin Anda edit dalam program pengeditan teks seperti Notepad.

Langkah 2

Edit atau tambahkan baris deskripsi untuk mengikuti format FASTA. Misalnya, > gi | 129295 | sp | P01013 | OVAX_CHICK GENE X PROTEIN (OVALBUMIN-RELATED) adalah baris deskripsi FASTA yang valid. Baris ini memberikan deskripsi unik untuk urutan data yang mengikuti. Format FASTA membutuhkan penggunaan simbol yang lebih besar dari (>) sehingga program dapat mengidentifikasi informasi deskriptif yang unik dan untuk menghindari pemrosesan deskripsi sebagai garis data urutan protein.

Langkah 3

Tekan "Enter" untuk menyisipkan jeda baris setelah Anda mengedit baris uraian.

Langkah 4

Edit atau tambahkan format jalur data urutan protein agar sesuai dengan kode IUB / IUPAC standar. Standar IUB / IUPAC menggunakan huruf abjad untuk mewakili kode yang dapat diterima atau urutan interogasi untuk asam amino atau asam nukleat dalam format FASTA. Misalnya, QIKDLLVSSSTDLDTTLVLVNAIYFKGMWKTAFNAEDTREMPFHVTKQESKPVQMMCMNNSFNVATLPAE mewakili baris urutan data yang valid karena diawali dengan huruf "Q", mewakili glutamine, dan diakhiri dengan huruf "E", yang mewakili glutamat.

Langkah 5

Tambahkan lebih banyak baris sekuens data, edit yang sudah ada atau tambahkan jeda baris setelah 80 karakter sesuai kebutuhan. Menambahkan standar garis dan jeda baris ke aliran data FASTA memastikan bahwa program mengikuti petunjuk yang terkait dengan glutamin, glutamat, dan kode huruf lainnya. Huruf-huruf dalam standar IUB / IUPAC hanyalah instruksi untuk program yang memproses data dalam format FASTA.

Langkah 6

Klik "File", pilih dan klik tombol "Simpan". File TXT Anda sudah dalam format FASTA.